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Analysis of interdomain taxonomic patterns in urban street mats
Vincent Hervé,
Summary: Streets are constantly crossed by billions of vehicles and pedestrians. Their gutters, which convey stormwater and contribute to waste management, and are important for human health and well‐being, probably play a number of ecological roles. Street surfaces may also represent an important part of city surface areas. To better characterize the ecology of this yet poorly explored compartment, we used filtration and DNA metabarcoding to address microbial community composition and assembly across the city of Paris, France. Diverse bacterial and eukaryotic taxonomic groups were identified, including members involved in key biogeochemical processes, along with a number of parasites and putative pathogens of human, animals and plants. We showed that the beta diversity patterns between bacterial and eukaryotic communities were correlated, suggesting interdomain associations. Beta diversity analyses revealed the significance of biotic factors (cohesion metrics) in shaping gutter microbial community assembly and, to a lesser extent, the contribution of abiotic factors (pH and conductivity). Co‐occurrences analysis confirmed contrasting non‐random patterns both within and between domains of life, specifically when comparing diatoms and fungi. Our results highlight microbial coexistence patterns in streets and reinforce the need to further explore biodiversity in urban ground transportation infrastructures.
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L'Appel à Projets de Recherche 2020 du Labex DRIIHM était ouvert jusqu'au 15 décembre 2019.
La plateforme de soumission est accessible sur ce site après connexion (et création de compte).
Vous pouvez consulter le cadrage de ces APR et les thématiques de recherche propres à chaque OHM en cliquant sur le version choisi ci-après : française et anglaise.
Nous vous rappelons que la soumission se fait en deux temps : l'entrée de la partie scientifique du projet à sauvegarder. Ce n'est qu'après cette étape que vous pourrez rentrer la partie administrative et budgétaire de votre projet. Ces deux étapes sont détaillées dans le cadrage général ci-dessus.
RAPPEL : Le porteur de projet doit appartenir à une unité CNRS ou un établissement partenaire financier du Labex (Université de Nîmes, Université de Pau et des Pays de l’Adour, AMU, Université Lyon 1, UBO, Université de Corse, Université des Antilles, Université de Lorraine, Université de Strasbourg, Université de Caen, ENS Lyon, INRA, MNHN, Ecole des mines Saint Etienne, Irstea et l’IRSN). Si le porteur n'appartient pas à l'un de ses établissements, il devra s'associer obligatoirement à un co-porteur qui l'est et dont l'unité gèrera le budget du projet.
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La campagne d’échantillonnage du projet COMMANGA « Communautés Microbiennes des Mangroves Guadeloupéennes et Anthropisation », porté par Vincent HERVE (Max Planck Institute for Terrestrial Microbiology) et Silvina GONZALEZ-RIZZO (Université des Antilles) a eu lieu du 05 au 13 Novembre 2019.
Un véritable succès avec 20 sites étudiés et la participation de Sébastien Cordonnier (Université des Antilles) et Josie Lambourdière (CNRS) ainsi que de collégiens et de leurs enseignants très enthousiastes. Un grand merci à tous.
La mangrove un écosystème important à préserver et à réhabiliter pour maintenir ses nombreux rôles écologiques (i.e., Carbone bleu, protection du littoral ...) et sa biodiversité terrestre et aquatique. Alors qu'on y voit encore bien des objets qui n'ont rien à y faire.
